L’Unité Mixte de Recherche Agap Institut (Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et tropicales) regroupe plus de 300 personnes développant une recherche scientifique d'excellence en biologie des plantes et génétique végétale et produit des connaissances pour répondre aux enjeux sociétaux majeurs de l'agriculture au Sud comme au Nord. Elle est placée sous la tutelle de quatre organismes de recherche et d’enseignement supérieur : le Cirad, l'Inrae, l'institut Agro Montpellier et l'Université de Montpellier. L’équipe GIV contribue à l’optimisation des méthodes de sélection et leur mise en œuvre sur plusieurs cultures annuelles (riz, sorgho, mil, coton et racines et tubercules) en partenariat avec des institutions de recherche et de développement des pays du Sud.

Le Cirad recrute un.e chercheur.e en génétique et amélioration variétale du cotonnier au sein de l’équipe Génétique et Innovation Variétale (GIV) de l’UMR AGAP Institut (Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes tropicales et méditerranéennes).

Le cotonnier est une plante industrielle, ayant pour débouchés principalement le secteur textile, mais également les secteurs alimentaires et cosmétiques. Dans les régions tropicales et subtropicales, il est une composante majeure de systèmes de production intégrant aussi des cultures vivrières. Renforcer la recherche sur les systèmes de production à base de coton dans les pays du Sud contribue au développement territorial et à l’autosuffisance alimentaire des populations de ces pays. Pour répondre aux défis actuels et à venir des filières cotonnières africaines, il est crucial de concevoir de nouvelles variétés en prenant en compte l’évolution des systèmes de production, les contraintes liées au changement climatique (CC) et la durabilité de la rentabilité et de la compétitivité de ces filières.

Les compétences recherchées sont celles d’un.e généticien.ne sélectionneur.se qui aura la capacité de mobiliser de nouvelles stratégies et méthodes de sélection et d’optimiser la prédiction des valeurs génétiques des génotypes candidats à la sélection.

Intégré.e au sein de l’équipe GIV de l’UMR AGAP à Montpellier, vous serez amené.e à effectuer des missions auprès des partenaires en charge des programmes de sélection et mettrez à profit ces collaborations pour développer un programme de recherche en cohérence avec les objectifs du poste. Une mobilité géographique chez l’un des partenaires pourrait être envisagée à plus long terme si l’équipe et ses projets le justifient.

La personne recrutée aura 4 objectifs majeurs :

- Contribuer à l'optimisation des programmes de sélection des différentes institutions partenaires du Cirad en charge de la création variétale du cotonnier en mobilisant des approches de modélisation et de simulation des programmes, et en intégrant, quand cela est possible et pertinent, des donnée génotypiques ou d’autres types d’omiques (spectres proches infra-rouge),

- Contribuer à la définition d’idéotypes adaptés à différents systèmes de production,

- Développer des populations, d'une part, pour alimenter les programmes de sélection en variabilité génétique pertinente et d'autre part, pour permettre l'analyse du déterminisme génétique des caractères clés pour les filières cotonnières (qualité technologique, adaptation aux effets du CC, adaptation aux itinéraires de production) dans le cadre d’études GxExM,

- Contribuer à la formation de jeunes chercheurs et d’étudiants et à l'animation d'un réseau régional d'évaluation de matériel végétal entre les différents instituts impliqués dans la sélection cotonnière.

 Certaines de ces activités seront conduites en proche collaboration avec des chercheurs d’autres unités du Cirad qui travaillent sur des systèmes de cultures durables et le développement de modèles de cultures adaptés au cotonnier (UR AIDA notamment).

·         Doctorat ou en dernière année de Thèse, en génétique et amélioration végétale ou animale

·         Compétences en génétique quantitative et biostatistiques (modèles mixtes linéaires et non linéaires, analyses multivariées…)

·         Connaissance de l’expérimentation agronomique et des méthodologies de sélection (une expérience dans ces domaines serait appréciée)

·         Capacité à mobiliser des approches innovantes (simulation, modélisation, données génotypiques, méthodes de phénotypage) pour l’optimisation des schémas de sélection

·         Appétence pour travail au sein de collectifs multidisciplinaires de recherche et de développement

·         Aptitude à la construction et la mise en œuvre de collaborations avec des partenaires de la recherche et du développement en milieu tropical (une expérience à l’étranger sera appréciée

·         Appétence pour un travail de terrain fréquent en milieu tropical en lien avec les partenaires de l’unité

·         Facilité de rédaction et capacité de valorisation scientifique des résultats de recherche

·         Expérience souhaitée en montage de projets

·         Capacité et goût pour l'encadrement d'étudiants

Maîtrise du français, bonne pratique de l'anglais écrit et oral